* 通讯作者：Jinbo Xu, jinboxu@moleculemind.com 参考文献 [1] Joseph L Watson, David Juergens, Nathaniel R Bennett, Brian L Trippe, Jason Yim, Helen E Eisenach, Woody Ahern, Andrew J Borst, Robert J Ragotte, Lukas F Milles, et al. De novo design of protein structure and function with rfdiffusion. Nature, 620 (7976):1089–1100, 2023. [2] Martin Pacesa, Lennart Nickel, Christian Schellhaas, Joseph Schmidt, Ekaterina Pyatova, Lucas Kissling, Patrick Barendse, Jagrity Choudhury, Srajan Kapoor, Ana Alcaraz-Serna, et al. One-shot design of functional protein binders with bindcraft. Nature, 646 (8084):483–492, 2025. [3] Vinicius Zambaldi, David La, Alexander E Chu, Harshnira Patani, Amy E Danson, Tristan OC Kwan, Thomas Frerix, Rosalia G Schneider, David Saxton, Ashok Thillaisundaram, et al. De novo design of high-affinity protein binders with alphaproteo. arXiv preprint arXiv:2409.08022, 2024. [4] Chai Discovery Team, Jacques Boitreaud, Jack Dent, Danny Geisz, Matthew McPartlon, Joshua Meier, Zhuoran Qiao, Alex Rogozhnikov, Nathan Rollins, Paul Wollenhaupt, et al. Zero-shot antibody design in a 24-well plate. bioRxiv, pages 2025–07, 2025. [5] Luis S Mille-Fragoso, John N Wang, Claudia L Driscoll, Haoyu Dai, Talal Widatalla, Xiaowei Zhang, Brian L Hie, and Xiaojing J Gao. Efficient generation of epitope-targeted de novo antibodies with germinal. bioRxiv, 2025. [6] Hannes Stark, Felix Faltings, Min Gyu Choi, Yuxin Xie, Eunsu Hur, Timothy O’Donnell, Anton Bushuiev, Talip Uçar, Saro Passaro, Weian Mao, et al. Boltzgen: Toward universal binder design. bioRxiv, pages 2025–11, 2025. [7] BioGeometry Team and Jian Tang. Rapid de novo antibody design with geoflow-v3. bioRxiv, pages 2025–10, 2025. [8] Sheng Xu, Qiantai Feng, Lifeng Qiao, Hao Wu, Tao Shen, Yu Cheng, Shuangjia Zheng, and Siqi Sun. Foldbench: An all-atom benchmark for biomolecular structure prediction. bioRxiv, pages 2025–05, 2025. [9] Josh Abramson, Jonas Adler, Jack Dunger, Richard Evans, Tim Green, Alexander Pritzel, Olaf Ronneberger, Lindsay Willmore, Andrew J Ballard, Joshua Bambrick, et al. Accurate structure prediction of biomolecular interactions with alphafold 3. Nature, 630 (8016):493–500, 2024. [10] Helen M Berman, John Westbrook, Zukang Feng, Gary Gilliland, Talapady N Bhat, Helge Weissig, Ilya N Shindyalov, and Philip E Bourne. The protein data bank. Nucleic Acids Research, 28 (1):235–242, 2000. [11] Claudio Mirabello and Björn Wallner. Dockq v2: improved automatic quality measure for protein multimers, nucleic acids, and small molecules. Bioinformatics, 40 (10):btae586, 2024. [12] Saro Passaro, Gabriele Corso, Jeremy Wohlwend, Mateo Reveiz, S. Thaler, Vignesh Ram Somnath, Noah Getz, Tally Portnoi, J. Roy, Hannes Stark, D. Kwabi-Addo, Dominique Beaini, Tommi Jaakkola, and Regina Barzilay. Boltz-2: Towards accurate and efficient binding affinity prediction. bioRxiv, pages 2025–06, 2025. [13] ByteDance Seed. Protenix-v2: Broadening the reach of structure prediction and biomolecular design. 2025. [14] ByteDance AML AI4Science Team, Xinshi Chen, Yuxuan Zhang, Chan Lu, Wenzhi Ma, Jiaqi Guan, Chengyue Gong, et al. Protenix—advancing structure prediction through a comprehensive alphafold 3 reproduction. bioRxiv, pages 2025–01, 2025. [15] Salvatore Candido et al. Language modeling materializes a world model of protein biology, 2026. URL https://github.com/biohub/esm. Biohub preprint. [16] Ivan Anishchenko, Samuel J Pellock, Tamuka M Chidyausiku, Theresa A Ramelot, Sergey Ovchinnikov, Jingzhou Hao, Khushboo Bafna, Christoffer Norn, Alex Kang, Asim K Bera, et al. De novo protein design by deep network hallucination. Nature, 600 (7889):547–552, 2021. 附录 A 设计 VHH 序列针对已知抗体数据库的 CDR 相似性分析 为评估设计序列相对于已知抗体序列的新颖性，我们对 338 个 VHH 序列进行了 CDR 相似性分析，涵盖 11 个靶标系统，并额外检查了每个系统中亲和力最高的 VHH 候选物。
GPT‑Rosalind 得分 63.2%，高于 GPT‑5.5 的 55.8%，同时 token 使用量减少 5.3%。
1、滚球app HorusEye 与基线模型之间的性能差距充分证明了大规模预训练的关键作用 —— 预训练编码器有效捕获了可迁移的结构与解剖特征表示。
10 万 Agent 跑一轮大约需要 3538 秒；在万级规模时，分布式部署比单机快了 3-4 倍。滚球appMonolith 投资人 严宽 谈到，大模型作为入口正重塑 AI4S 的价值逻辑。
2、特朗普踢到铁板后，才知“中国崩溃论”有多蠢，他骂章家敦没毛病
图示：GPT-Rosalind 在 BixBench 上表现出的领先性能。
3、光盘之死
目前，售票平台上该场次页面已标注为取消状态。
4、被怀疑泄露“万斯曾计划用副总统专机送儿子上高尔夫球课”消息，美特勤局一名特工被停职调查
更何况，在日本外相茂木敏充飞赴马尼拉之际，日本防相小泉进次郎刚又在大放厥词，还号称“日本应毫无禁忌地讨论与核武器相关的政策”。
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管理木荷苑、结香苑的上海世江物业管理有限公司工作人员则反馈，两个小区两道消防门多年来的确不开，因为此前门外没有道路，以后会随着外部道路建设的完成，为消防门“开口”，解决“生命通道”的通畅问题。
最先上报问题的，恰恰就是施工单位，施工人员去现场勘测时发现了异常。
”它在这个夏天再次刷屏，跨越时光仍击中人心。
6、AC米兰中场大洗牌，5人接受阿莫林评估，霍伊别尔成目标
【阿联酋航空致歉】昨晚，阿联酋航空发布致歉信。
随着时间推移，他们预计这些系统将成为越来越有能力的发现伙伴——帮助科学家更快地从问题走向证据，从证据到洞察，从洞察到患者新疗法。
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多名邓州本地人告诉记者，当地有不少人在杭州等城市务工，很多人会通过微信群拼私家车往返，其中有一些是专做长途的黑车，还有老板会招司机来开车。
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8、受台风“红霞”影响，26日广东省内铁路全线停运
在今年香格里拉对话会上胡说八道的特奥多罗图：视频截屏 还要看到，就中国来说，对菲律宾高官所表露的态度其实是在意的。
此后，王某诉至法院，请求撤销第二份委托协议，并判令某公司退还相关款项及支付资金占用利息。
文章呼吁多方重构资助机制、建立跨学科会议和开放工具链，把成功指标从单一论文变成共享平台、联合 benchmark 和多站点复现。
9、曼联补强开启！卡里克钦点两大中场悍将，豪砸超1亿欧
在世界杯中大放异彩的佛得角门将沃齐尼亚身价从5万欧涨至50万欧。
该工作将 OPD 从语言模型偏好对齐拓展到蛋白质设计场景，并进一步推进到多目标、多教师设置，为生成式蛋白设计中的高效偏好对齐提供了新的技术参考。
10、心脏好不好，关键看这8个“硬指标”！超标一条就很危险
这一机制还带来一个重要性质：归一化项可以反映教师之间的分歧程度。
科学直觉揭示未来 经研究团队证明，用 SOFisher 指导采样的单组学数据（仅空间转录组），在分析阿尔茨海默病与野生型小鼠的差异时，其揭示的生物学洞察甚至优于用全切片多组学数据的传统方法。
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4、零时差
在文章「A multimodal large language model for materials science」中，MatterChat 把预训练的语言模型和预训练的材料模型用一个桥接模块连起来，让模型既能看懂原子结构，也能用自然语言回答材料问题。
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所有主图中的统计图表均由 Robin 自动生成。
从最有利于未成年人原则出发，法院驳回了小林要求“禁止接触”的申请部分。
当时同车的两人均幸存，其中19岁的司机仅受轻伤，另一名乘客则未在现场接受治疗。
7、中央气象台继续发布高温黄色预警 敦煌多景区启动应急预案
图 1：ESMFold2 架构。
智能爆炸仍然面临巨大阻力 不过，并不是所有人都认为“奇点”已经近在眼前。
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有人凑过来看字，赞叹写得安静。
“画会初创时，瘦铁先生是发起人之一，”裘先生说，“想着放你那里，更有用。
另外，海牛夏窗从津门虎租借来的李嗣镕也因回避条款无法出战。
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- 1 当赋予智能体访问 gget 病毒的权限时，所有智能体的准确率都超过了 90%，GPT-5.5 的准确率峰值达到 99.7%。
- 2 为了让 MLP 具备泛化能力，研究团队构建了一个覆盖极广的训练集，包含从 C₆₀富勒烯到一维碳链、二维石墨烯、三维金刚石的各种结构；不同杂化态的混合体系；极端力学状态（从 -400 GPa 的拉伸到超过 1000 GPa 的压缩）。
- 3 记者看到，在评论区不少网友就此事展开激烈讨论，有网友认为下铺旅客拥有优先使用权，也有网友表示，下铺下方应该是公共空间，先到先得，如果行李没有位置放可以找列车员协调。
- 4 刘女士提供的一份店铺经营注册信息显示，该商家名为“瑞丽市沅抑珠宝店”，为个体工商户，经营者为宁某某，注册地址为云南省德宏州瑞丽市弄岛镇等秀村一房屋，天眼查信息显示，该珠宝店在今年5月份被瑞丽市市场监督管理局列入经营异常名录。
- 5 但也要注意到，在此期间，王毅对有些国家的外长选择了“不见”。
- 6 山东海参产业根基雄厚，养殖总面积达136.5万亩，年产量10.3万吨，产量占全国32.5%，苗种产能、加工规模超全国六成，全产业链产值突破500亿元。
- 7 IL-2（接近角度 67°-80°）、IL-20（质心距离 14.7 Å）和 BHRF1（接近角度 123°）的设计 VHH 与 PDB 中可用的 IgG/Fab 复合物存在实质性分歧，表明这些设计从检索到的参考抗体结构未代表的取向接合靶标。
- 8 属于《市场监督管理投诉举报处理办法》第二十三条第二款：投诉人、被投诉人无正当理由不参加调解，或者明确拒绝调解的情形，依据《市场监督管理投诉举报处理办法》的规定，该局决定终止调解。
- 9 这或许就是两位菲尔兹奖得主带给万千学子、家长最重要的启示。
- 10 在最初的部署中，物理隔离是必要的。
- 11 系统发现了一个有趣的悖论：邻居之间越来越像（平均相似度 + 21%），但全局并没有走向统一，而是稳定在大约 65 个文化「小岛」上 —— 形成「组内趋同、组间分化」模式。
- 12 伊朗究竟是否在绰号“镐山”的地方秘密核开发？多年来，伊朗方面都予以否认，但美国却揪着不放，威胁炸掉“镐山”，彻底摧毁伊朗核能力，防止中东核扩散。
- 13 小时候两人经常一起玩，但他对其近况也不太了解，只是偶尔在李某某回家拜年时听对方说了一些情况。
- 14 面向实际电池，性能验证更接近应用场景 为了检验这种电解质在全电池中的表现，研究团队将其与磷酸铁锂和高镍 NCM811 正极进行匹配。
- 15 接到投诉线索后，我局高度重视，立即组织执法人员核实情况，并启动投诉调解处理程序。
- 16 他强调：“暗八仙纹样不受画面空间限制，适应性极强，长期作为吉祥符号融入百姓衣食住行，也是中国民间美术极具代表性的经典母题。
- 17 这是我们未来进行数学研究的新方式的开始。
- 18 明嘉资本先后投资了火辣健身、第一车贷、寿全斋姜茶，芭比辣妈、同道大叔、野马现场、蓝色极限、Innail等项目。
- 19 作为实现「AI 虚拟细胞」（AI Virtual Cell, AIVC）宏伟蓝图中不可或缺且挑战最大的核心环节，AIVM 的提出填补了当前领域的空白，为虚拟代谢研究指明了全新方向。
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